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恒溫?zé)晒釶CR檢測(cè)儀的檢測(cè)技術(shù)

發(fā)表時(shí)間:2025-09-22

恒溫?zé)晒?/span>PCR檢測(cè)儀的核心檢測(cè)技術(shù),是在無需復(fù)雜溫度循環(huán)裝置的前提下,通過特定分子機(jī)制實(shí)現(xiàn)核酸(DNA/RNA)的高效擴(kuò)增與實(shí)時(shí)熒光信號(hào)監(jiān)測(cè),最終完成靶標(biāo)(如病原體、基因片段等)的定性或定量分析,其技術(shù)體系圍繞“恒溫?cái)U(kuò)增”與“熒光檢測(cè)”兩大核心構(gòu)建,兼具快速、便攜、高特異性的優(yōu)勢(shì),廣泛適配基層醫(yī)療、現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)(POCT)、食品安全篩查等場(chǎng)景,核心技術(shù)路徑可從擴(kuò)增原理、熒光信號(hào)識(shí)別、關(guān)鍵輔助技術(shù)三個(gè)維度展開。

在恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)層面,這是區(qū)別于傳統(tǒng)PCR(依賴95℃變性、55-65℃退火、72℃延伸的溫度循環(huán))的核心,其核心邏輯是通過酶促反應(yīng)或核酸分子構(gòu)象變化,在單一溫度(通常為60-65℃)下打破核酸雙鏈的穩(wěn)定性,同時(shí)驅(qū)動(dòng)引物與模板結(jié)合、新鏈合成的持續(xù)進(jìn)行。目前主流的恒溫?cái)U(kuò)增機(jī)制主要包括三類:

其一為依賴解旋酶的擴(kuò)增技術(shù)(Helicase-Dependent Amplification, HDA) 。該技術(shù)模擬生物體內(nèi)DNA復(fù)制的天然過程,利用熱穩(wěn)定解旋酶(如來自水生棲熱菌的UvrD解旋酶)在恒溫下直接解開靶標(biāo)核酸的雙鏈結(jié)構(gòu),無需高溫變性;隨后,DNA聚合酶(如Bst DNA聚合酶)以解開的單鏈為模板,結(jié)合特異性引物合成新鏈,新合成的雙鏈又會(huì)被解旋酶再次解開,形成“解旋-擴(kuò)增”的循環(huán),實(shí)現(xiàn)靶標(biāo)核酸的指數(shù)級(jí)增長(zhǎng)。HDA技術(shù)的優(yōu)勢(shì)在于反應(yīng)體系簡(jiǎn)單,僅需解旋酶、聚合酶、引物、dNTP等基礎(chǔ)組分,且對(duì)模板純度要求較低,適合臨床樣本(如血液、咽拭子)的直接檢測(cè)。

其二為環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(Loop-Mediated Isothermal Amplification, LAMP) ,這是目前應(yīng)用十分廣泛的恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)之一,其核心是設(shè)計(jì)4-6條特異性引物(包括2條內(nèi)引物、2條外引物,以及可選的2條環(huán)引物),分別識(shí)別靶標(biāo)核酸上的6-8個(gè)特異性區(qū)域,通過Bst DNA聚合酶(具有鏈置換活性)的作用,在恒溫下啟動(dòng)鏈置換擴(kuò)增:外引物先結(jié)合模板合成新鏈,置換出原有互補(bǔ)鏈;內(nèi)引物隨后結(jié)合置換出的單鏈,合成更長(zhǎng)的新鏈并進(jìn)一步置換,同時(shí)形成具有莖環(huán)結(jié)構(gòu)的DNA片段;環(huán)引物則可結(jié)合莖環(huán)結(jié)構(gòu)的單鏈環(huán)區(qū)域,加速擴(kuò)增反應(yīng),使擴(kuò)增效率較傳統(tǒng)PCR提升10-100倍,反應(yīng)時(shí)間通常可縮短至30-60分鐘。LAMP的高特異性源于多引物的“多重識(shí)別”機(jī)制,非靶標(biāo)核酸因無法與所有引物匹配而難以啟動(dòng)擴(kuò)增,大幅降低假陽性風(fēng)險(xiǎn);同時(shí),環(huán)引物的加入可使反應(yīng)速度進(jìn)一步提升,適配快速檢測(cè)需求。

其三為依賴核酸內(nèi)切酶的擴(kuò)增技術(shù)(Nicking Enzyme Amplification Reaction, NEAR) 。該技術(shù)通過核酸內(nèi)切酶(切口酶)與DNA聚合酶的協(xié)同作用實(shí)現(xiàn)擴(kuò)增:先設(shè)計(jì)一條含有切口酶識(shí)別位點(diǎn)的特異性引物,其與靶標(biāo)單鏈結(jié)合后,切口酶會(huì)在識(shí)別位點(diǎn)處切開引物鏈,形成一個(gè)“切口”;隨后,DNA聚合酶(如Vent DNA聚合酶)從切口處開始延伸,同時(shí)置換出原有引物的下游片段,被置換的單鏈又可作為新模板,與另一條引物結(jié)合并啟動(dòng)新一輪“切口-延伸-置換”循環(huán),最終實(shí)現(xiàn)靶標(biāo)核酸的線性或指數(shù)級(jí)擴(kuò)增。NEAR技術(shù)的特點(diǎn)是擴(kuò)增產(chǎn)物以單鏈為主,更易與熒光探針結(jié)合,且反應(yīng)過程中無復(fù)雜二級(jí)結(jié)構(gòu)形成,信號(hào)背景更低,適合低濃度靶標(biāo)的精準(zhǔn)檢測(cè)。

在熒光信號(hào)檢測(cè)與分析技術(shù)層面,其核心是通過特異性熒光探針或熒光染料,將核酸擴(kuò)增過程轉(zhuǎn)化為可實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)的熒光信號(hào),再通過光學(xué)系統(tǒng)采集與數(shù)據(jù)解析,完成靶標(biāo)的定性/定量判斷。根據(jù)信號(hào)來源,可分為“熒光染料法”與“熒光探針法”兩類:

熒光染料法是較簡(jiǎn)便的信號(hào)檢測(cè)方式,常用染料為SYBR Green I等嵌入型熒光染料。這類染料本身熒光信號(hào)微弱,但可特異性結(jié)合到擴(kuò)增過程中形成的雙鏈DNAdsDNA)的小溝區(qū)域,結(jié)合后熒光信號(hào)強(qiáng)度會(huì)提升數(shù)千倍。在檢測(cè)過程中,染料隨擴(kuò)增產(chǎn)物的積累而持續(xù)結(jié)合,恒溫?zé)晒?/span>PCR檢測(cè)儀的光學(xué)模塊(包括激發(fā)光源、濾光片、光電探測(cè)器)會(huì)實(shí)時(shí)采集熒光信號(hào),通過信號(hào)強(qiáng)度的變化判斷是否存在靶標(biāo)(定性檢測(cè)),或通過與標(biāo)準(zhǔn)品的信號(hào)對(duì)比計(jì)算靶標(biāo)濃度(定量檢測(cè))。該方法的優(yōu)勢(shì)是無需設(shè)計(jì)特異性探針,成本較低,但缺點(diǎn)是染料會(huì)非特異性結(jié)合所有雙鏈DNA(包括引物二聚體、非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物),可能導(dǎo)致假陽性信號(hào)干擾,因此更適合對(duì)特異性要求不高的初步篩查場(chǎng)景。

熒光探針法則通過設(shè)計(jì)與靶標(biāo)擴(kuò)增區(qū)域互補(bǔ)的特異性熒光探針,實(shí)現(xiàn)更高精度的信號(hào)識(shí)別。常見的探針類型包括TaqMan探針、分子信標(biāo)(Molecular Beacon)等。以TaqMan探針為例,其為一條兩端分別標(biāo)記熒光基團(tuán)(如FAM)和淬滅基團(tuán)(如TAMRA)的寡核苷酸鏈,探針未被降解時(shí),淬滅基團(tuán)通過熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)抑制熒光基團(tuán)發(fā)光;當(dāng)擴(kuò)增反應(yīng)進(jìn)行時(shí),DNA聚合酶(需具有5'-3'核酸外切酶活性)延伸引物的同時(shí),會(huì)將結(jié)合在模板上的探針酶切降解,使熒光基團(tuán)與淬滅基團(tuán)分離,釋放出熒光信號(hào)。由于探針僅與靶標(biāo)序列特異性結(jié)合,只有當(dāng)靶標(biāo)存在時(shí)才會(huì)產(chǎn)生熒光信號(hào),因此可有效排除非特異性擴(kuò)增的干擾,特異性遠(yuǎn)高于染料法。分子信標(biāo)探針則通過莖環(huán)結(jié)構(gòu)實(shí)現(xiàn)信號(hào)調(diào)控:探針兩端的互補(bǔ)序列形成 “莖部”,使熒光基團(tuán)與淬滅基團(tuán)靠近而無信號(hào);當(dāng)探針與靶標(biāo)單鏈結(jié)合時(shí),莖環(huán)結(jié)構(gòu)解開,熒光基團(tuán)與淬滅基團(tuán)分離,產(chǎn)生熒光。這類探針的優(yōu)勢(shì)是可通過設(shè)計(jì)不同莖環(huán)長(zhǎng)度適配不同靶標(biāo),且信號(hào)背景極低,適合多靶標(biāo)同時(shí)檢測(cè)(多重檢測(cè))。

無論是染料法還是探針法,恒溫?zé)晒?/span>PCR檢測(cè)儀的光學(xué)系統(tǒng)均需具備高靈敏度與穩(wěn)定性:激發(fā)光源(通常為LED 燈,適配不同熒光基團(tuán)的激發(fā)波長(zhǎng),如488nm對(duì)應(yīng)FAM532nm對(duì)應(yīng)HEX)需提供穩(wěn)定的光強(qiáng),避免因光強(qiáng)波動(dòng)導(dǎo)致信號(hào)誤判;濾光片組需精準(zhǔn)過濾雜散光,僅讓目標(biāo)波長(zhǎng)的熒光信號(hào)通過;光電探測(cè)器(如光電倍增管PMT 或硅基光電二極管)則將微弱的熒光信號(hào)轉(zhuǎn)化為電信號(hào),再通過數(shù)據(jù)處理模塊轉(zhuǎn)化為實(shí)時(shí)熒光曲線(如熒光強(qiáng)度-時(shí)間曲線)。通過分析曲線的“起峰時(shí)間”(靶標(biāo)濃度越高,起峰越早)或“平臺(tái)期熒光強(qiáng)度”(與擴(kuò)增產(chǎn)物總量相關(guān)),即可完成定性(判斷是否起峰)或定量(通過標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算濃度)分析。

在關(guān)鍵輔助技術(shù)層面,其作用是保障恒溫?cái)U(kuò)增與熒光檢測(cè)的高效性、準(zhǔn)確性,主要包括樣本前處理適配技術(shù)、恒溫控制技術(shù)與防污染技術(shù)。

樣本前處理適配技術(shù)針對(duì)不同來源的樣本(如全血、唾液、食品樣本),提供快速核酸提取方案。由于恒溫?cái)U(kuò)增對(duì)樣本中的抑制劑(如血紅蛋白、蛋白酶、多糖)耐受性較強(qiáng),恒溫?zé)晒?/span>PCR檢測(cè)儀常搭配“一步法”提取模塊:例如,通過裂解液快速破壞細(xì)胞/病毒外殼,釋放核酸;再利用磁珠法(磁珠表面修飾核酸結(jié)合基團(tuán))在磁場(chǎng)作用下實(shí)現(xiàn)核酸的快速吸附、洗滌與洗脫,整個(gè)過程可在10-15分鐘內(nèi)完成,且無需大型離心設(shè)備,適配現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)。部分高端設(shè)備還集成“樣本直接擴(kuò)增”技術(shù),通過優(yōu)化反應(yīng)緩沖液(加入抑制劑清除劑,如BSA、酪蛋白),實(shí)現(xiàn)樣本(如咽拭子裂解液)不經(jīng)過純化直接進(jìn)入擴(kuò)增反應(yīng),進(jìn)一步縮短檢測(cè)時(shí)間。

恒溫控制技術(shù)是保障擴(kuò)增效率的核心,需將反應(yīng)體系溫度精準(zhǔn)維持在設(shè)定范圍(誤差通常需<±0.5℃)。主流方案包括“金屬浴加熱”與“珀?duì)柼訜帷保航饘僭〖訜嵬ㄟ^將反應(yīng)孔模塊與恒溫金屬塊(如鋁塊)緊密接觸,利用電阻絲加熱金屬塊,結(jié)合溫度傳感器(如PT1000鉑電阻)實(shí)時(shí)反饋溫度,通過PID(比例-積分-微分)算法調(diào)節(jié)加熱功率,實(shí)現(xiàn)溫度穩(wěn)定;珀?duì)柼訜釀t利用半導(dǎo)體材料的“熱電效應(yīng)”,通過電流方向控制制熱或制冷,響應(yīng)速度更快(升溫速率可達(dá)5-10/s),且體積更小,適合便攜式檢測(cè)儀。此外,部分設(shè)備會(huì)在反應(yīng)孔模塊表面涂覆導(dǎo)熱涂層(如石墨烯涂層),提升溫度均勻性,避免因局部溫差導(dǎo)致的擴(kuò)增效率差異。

防污染技術(shù)則針對(duì)核酸擴(kuò)增中易出現(xiàn)的“假陽性”問題(源于前次檢測(cè)殘留的擴(kuò)增產(chǎn)物氣溶膠)。核心技術(shù)包括“尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)防污染”與“物理隔離防污染”:UDG防污染是在反應(yīng)體系中加入UDG酶,該酶可特異性降解含有尿嘧啶的DNA(在擴(kuò)增時(shí)用dUTP替代部分dTTP,使擴(kuò)增產(chǎn)物含尿嘧啶),而天然靶標(biāo)核酸(含胸腺嘧啶)不受影響,從而在反應(yīng)開始前清除殘留的擴(kuò)增產(chǎn)物;物理隔離防污染則通過恒溫?zé)晒?/span>PCR檢測(cè)儀的結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn),例如采用“密封反應(yīng)管”(如帶透氣膜的螺旋蓋,防止氣溶膠泄漏)、“負(fù)壓檢測(cè)腔”(通過負(fù)壓吸附氣溶膠,避免擴(kuò)散),或在光學(xué)檢測(cè)窗口設(shè)置可更換的 “防污染膜”,減少交叉污染風(fēng)險(xiǎn)。

恒溫?zé)晒?/span>PCR檢測(cè)儀的檢測(cè)技術(shù)是一個(gè)“擴(kuò)增-檢測(cè)-保障”協(xié)同的體系:恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)突破了傳統(tǒng) PCR 對(duì)溫度循環(huán)的依賴,實(shí)現(xiàn)快速高效的核酸復(fù)制;熒光檢測(cè)技術(shù)通過特異性信號(hào)識(shí)別,將擴(kuò)增過程轉(zhuǎn)化為可量化的結(jié)果;樣本前處理、恒溫控制、防污染等輔助技術(shù)則保障了檢測(cè)的穩(wěn)定性與準(zhǔn)確性。這種技術(shù)體系既保留了PCR的高特異性與高靈敏度,又通過“恒溫”設(shè)計(jì)簡(jiǎn)化了設(shè)備結(jié)構(gòu),使其更適配非實(shí)驗(yàn)室場(chǎng)景的檢測(cè)需求,目前已在新冠病毒檢測(cè)、流感病毒分型、食源性致病菌篩查(如沙門氏菌、李斯特菌)、動(dòng)物疫病診斷(如非洲豬瘟)等領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)廣泛應(yīng)用。

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